Организация вызова подпрограмм вычисления сингулярных чисел матриц и вычисление времени, затраченного на решение задачи
Эта служебная подпрограмма организует за пользователя правильный вызов
целевых подпрограмм вычисления сингулярных чисел матриц и вычисление
времени, затраченного на решение задачи на заданном числе параллельных
процессов (NPROCS) с матрицей заданного порядка (N) и при заданных параметрах
распараллеливания (NPROW, NPCOL, NB ).
Сначала она либо считывает из внешнего файла, заданную пользователем исходную
матрицу, либо строит некую "стандартную" матрицу порядка N; распределяет её
части(блоки) по параллельным процессам в соответствии с используемыми
алгоритмами и формирует правильный список фактических параметров для
выбранной пользователем целевой подпрограммы.
После этого осуществляет вызов и счет по этой подпрограмме, вычисляя при этом
время, прошедшее с момента обращения к подпрограмме до момента выхода из неё.
Полученный массив сингулярных чисел записывается во внешний файл.
Литература:
http://software.intel.com/en-us/articles/intel-math-kernel-library-documentation/
http://www.netlib.org/scalapack/slug/index.html
http://num_anal.srcc.msu.ru/par_prog/
CALL CAL_GESVD1N( NAME, M, N, NPROW, NPCOL, AMEM, MEMSIZE, NB, INFILEA, OUTFILE, TFILE, NPRT, CTXT )
Параметры
NAME - | имя целевой подпрограммы, при применении которой для решения задачи вычисляется время, затраченное на ее решение (одно из PDGESVD1, PDGESVD4); (входной параметр, тип символьный); |
M - | число строк исходной матрицы, при котором вычисляется время, затраченное на решение задачи (входной параметр, тип целый); |
N - | число столбцов исходной матрицы, при котором вычисляется время, затраченное на решение задачи (входной параметр, тип целый); |
NPROW - | число строк в решетке процессов, для которой измеряется время на решение задачи (входной параметр, тип целый); |
NPCOL - | число столбцов в решетке процессов, для которой измеряется время на решение задачи (входной параметр, тип целый); |
AMEM - | массив локальной рабочей памяти, в которую распределяется локальная часть исходной матрицы, хранятся элементы рабочих массивов, где формируются локальные части массива сингулярных чисел (входной параметр, тип DOUBLE PRECISION); |
MEMSIZE - | задаваемый размер массива AMEM, который должен быть больше или равен значению параметра MMIN, выданному пользователю соответствующей подпрограммой вычисления параметров PAR_GESVD1 при задании ей набора параметров распараллеливания, при которых измеряется время, затраченное на решение задачи (см.Автоматизация доступа к подпрограммам Комплекса (входной параметр, тип целый); |
NB - | размер блока, матрицы, при котором измеряется время на решение задачи (входной параметр, тип целый); |
INFILEA - | имя файла, содержащего исходную матрицу (A) либо " "(пробел); в последнем случае будет использована некая "стандартная" матрица заданного порядка (входной параметр, тип символьный); |
OUTFILE - | имя файла, в который в результате работы подпрограммы будет записан результирующий массив сингулярных чисел (входной параметр, тип символьный). |
TFILE - |
имя файла, в который записывается время, затраченное на решение
задачи при заданном наборе параметров распараллеливания; при обращении к подпрограмме CAL_GESVD1N в цикле с разными наборами параметров распараллеливания в данный файл будут записаны все результаты таймирования, полученные при всех вычислительных экспериментах, выполненных в данном запуске подпрограммы BSTPAR9, инициирующей групповой запуск нескольких вычислительных экспериментов (т.е. нескольких вызовов подпрограммы CAL_GESVD1N с разными наборами параметров) (входной параметр, тип символьный); |
NPRT - |
режим выдачи результатов вычислительного эксперимента: = 0 - на печать не выдается ничего, кроме минимального времени счета полученного в данном эксперименте и значений параметров распараллеливания, при которых получено это минимальное время; = 1 - на печать выдаются все результаты таймирования ( при всех испытанных в данном групповом запуске наборах параметров распараллеливания ); = 2 - на печать выдается все то же самое, что и при NPRT = 1, а также результаты решения самой задачи целевой программой Комплекса для заданной матрицы; = 3 - на печать выдается все то же самое, что и при NPRT = 2, а также все входные параметры и матрицы (входной параметр, тип целый); |
CTXT - | значение параметра контекста, соответствующего выбранной решетке процессов (входной параметр, тип целый) |
Вызываемые подпрограммы
Здесь указаны только целевые (1 - ого уровня) и базовые подпрограммы (2 - ого уровня), которые вызываются из целевых подпрограмм.
PDGESVD1 - PDGESVD4 |
сингулярное разложение квадратной матрицы с вычислением всех сингулярных чисел; сингулярное разложение прямоугольной матрицы с вычислением всех сингулярных чисел; соответственно |
MINTGESVD1 - | Построение некоторой "стандартной" квадратной матрицы заданного порядка N и распределение ее частей(блоков) по параллельным процессам ( в том случае, если не был задан файл с исходной матрицей ) |
Замечания по использованию
1. | Используются подпрограммы BLACS_EXIT, BLACS_GET, BLACS_GRIDEXIT, BLACS_GRIDINFO BLACS_GRIDINIT, BLACS_PINFO, BLACS_SETUP, IGSUM2D ( из пакета BLACS в составе MKL-библиотеки), DESCINIT, ICEIL, NUMROC, PDLAPRNT ( из пакета ScaLAPACK(TOOLS) в составе MKL-библиотеки), PDLAREAD, PDLAWRITE, MPI_Wtime() | |
2. | Время, затраченное на решение задачи, присваивается переменной time, описанной в общем блоке |
Требуется вычислить время, необходимое для вычисления сингулярных чисел матрицы с помощью подпрограммы PDGESVD1.
При этом матрица - порядка 7000. Для решения задачи предполагается использовать 8 процессоров,
образующих решетку 8 * 1.
Матрица делится на блоки 70 * 70 (т.е. NB = 70 )
При предварительном обращении к подпрограмме PAR_GESVD1 с указанными выше параметрами был вычислен
максимальный размер локальной памяти, необходимой для решения задачи MMIN = 6593933.
Для вычисления используется "стандартная" матрица, построение и распределение которой по процессам
выполняется служебной подпрораммой MINTGESVD1.
Фрагмент фортранного текста вызывающей программы
(полный текст теста можно получить в
tcl_gesvd1n.zip)
PROGRAM TCL_GESVD1N include 'mpif.h' INTEGER M, N, NPROW, NPCOL, NB, MEMSIZE * PARAMETER ( N=7000, NB=70, MEMSIZE= 6700000, NPRT= 1 ) * DOUBLE PRECISION AMEM( MEMSIZE ) CHARACTER*(*) NAME CHARACTER INFILEA*(*), OUTFILE*(*), TFILE*(*) PARAMETER ( INFILEA = ' ', $ OUTFILE = 'BSTPARRES', $ TFILE = 'BSTRES') * PARAMETER ( NAME = 'PDGESVD1') COMMON time, J EXTERNAL CAL_GESVD1N, BLACS_GET, BLACS_GRIDINIT, BLACS_GRIDINFO * NPROW = 8 NPCOL = 1 * CALL BLACS_GET( -1, 0, CTXT ) * CALL BLACS_GRIDINIT( CTXT, 'R', NPROW, NPCOL ) CALL BLACS_GRIDINFO( CTXT, NPROW, NPCOL, MYROW, MYCOL ) * CALL CAL_GESVD1N(NAME, M, N, NPROW, NPCOL, AMEM, MEMSIZE, NB, $ INFILEA, OUTFILE, TFILE, NPRT, CTXT ) * STOP END Результаты: Время решения задачи time = 0.285D+03 Сингулярные числа матрицы (в файле OUTFILE) S(1) = 34045148.0661785 ; S(2) = 6260093.41975719 ; . . . . . . . . . S(6998) = 3.50220686755503 ; S(6999) = 2.28844031095804 ; S(7000) = 1.00000000287643 ; Добавим, что минимальное время получено для решетки ( 2, 4 ) и NB = 42 time = 0.262D+03