Организация вызова целевой подпрограммы Комплекса для решения систем линейных алгебраических уравнений с симметричными или эрмитовыми положительно определенными матрицами и вычисление времени, затраченного на решение задачи
Эта служебная подпрограмма организует за пользователя правильный вызов
целевой подпрограммы решения систем линейных алгебраических
уравнений с симметричными или эрмитовыми положительно определенными
матрицами и вычисляет время решения задачи на заданном числе параллельных
процессов (NPROCS) с матрицей заданного порядка (N) и при заданных параметрах
распараллеливания (NPROW, NPCOL, NB ).
Сначала она либо считывает из внешних файлов, заданные пользователем исходную
матрицу системы и вектор (матрицу) правой части, либо строит некую "стандартную"
матрицу и вектор порядка N; распределяет их части(блоки) по параллельным
процессам в соответствии с используемыми алгоритмами и формирует правильный список
фактических параметров для выбранной пользователем целевой подпрограммы.
После этого осуществляет вызов и счет по этой подпрограмме, вычисляя при этом время,
прошедшее с момента обращения к подпрограмме до момента выхода из неё. Полученный вектор
решения задачи записывается во внешний файл.
Литература:
http://software.intel.com/en-us/articles/intel-math-kernel-library-documentation/
http://www.netlib.org/scalapack/slug/index.html
http://num_anal.srcc.msu.ru/par_prog/
CALL CAL_POSVN( NAME, UPLO, N, NPROW, NPCOL, AMEM, MEMSIZE, NB, INFILEA, INFILEB, OUTFILE, TFILE, NPRT, CTXT )
Параметры
NAME - | имя целевой подпрограммы, при применении которой для решения задачи вычисляется время, затраченное на ее решение (одно из PDPOSV, PDPOSV1, PDPOSV2); (входной параметр, тип символьный); |
UPLO - | переменная символьного типа, означающая, сохраняется нижняя или верхняя треугольная матрица и принимающая значения 'U'(верхняя) или 'L'(нижняя) (входной параметр); |
N - | порядок исходной матрицы системы, при котором вычисляется время, затраченное на решение задачи (входной параметр, тип целый); |
NPROW - | число строк в решетке процессов, для которой измеряется время на решение задачи (входной параметр, тип целый); |
NPCOL - | число столбцов в решетке процессов, для которой измеряется время на решение задачи (входной параметр, тип целый); |
AMEM - | массив локальной рабочей памяти, в которую распределяются локальные части исходных матриц и векторов системы, хранятся элементы рабочих массивов, где формируются локальные части вектора решений системы; (входной параметр, тип DOUBLE PRECISION); |
MEMSIZE - | задаваемый размер массива AMEM, который должен быть больше или равен значению параметра MMIN, выданному пользователю соответствующей подпрограммой вычисления параметров PAR_POSV при задании ей набора параметров распараллеливания, при которых измеряется время, затраченное на решение задачи (см.Автоматизация доступа к подпрограммам Комплекса (входной параметр, тип целый); |
NB - | размер блока матрицы, при котором измеряется время на решение задачи (входной параметр, тип целый); |
INFILEA - | имя файла, содержащего исходную матрицу системы (A), либо " "(пробел); в последнем случае будет использована некая "стандартная" матрица заданного порядка (входной параметр, тип символьный); |
INFILEB - | имя файла, содержащего исходный вектор правой части системы (B), либо " "(пробел); в последнем случае будет использован некий "стандартный" вектор заданного порядка (входной параметр, тип символьный); |
OUTFILE - | имя файла, в который в результате работы подпрограммы будет записан результирующий вектор (X) (входной параметр, тип символьный); |
TFILE - |
имя файла, в который записывается время, затраченное на решение
задачи при заданном наборе параметров распараллеливания; при обращении к подпрограмме CAL_POSVN в цикле с разными наборами параметров распараллеливания в данный файл будут записаны все результаты таймирования, полученные при всех вычислительных экспериментах, выполненных в данном запуске подпрограммы BSTPAR9, инициирующей групповой запуск нескольких вычислительных экспериментов (т.е. нескольких вызовов подпрограммы CAL_POSVN с разными наборами параметров) (входной параметр, тип символьный); |
NPRT - |
режим выдачи результатов вычислительного эксперимента: = 0 - на печать не выдается ничего, кроме минимального времени счета полученного в данном эксперименте и значений параметров распараллеливания, при которых получено это минимальное время; = 1 - на печать выдаются все результаты таймирования ( при всех испытанных в данном групповом запуске наборах параметров распараллеливания ); = 2 - на печать выдается все то же самое, что и при NPRT = 1, а также результаты решения самой задачи целевой программой Комплекса для заданной матрицы; = 3 - на печать выдается все то же самое, что и при NPRT = 2, а также все входные параметры и матрицы (входной параметр, тип целый); |
CTXT - | значение параметра контекста, соответствующего выбранной решетке процессов (входной параметр, тип целый) |
Вызываемые подпрограммы
Здесь указаны только целевые (1 - ого уровня) и базовые подпрограммы (2 - ого уровня), которые вызываются из целевых подпрограмм.
PDPOSV -
PDPOSV1 PDPOSV2 |
решение системы с симметричной (эрмитовой) положительно определенной матрицей
методом Холецкого или решение системы с симметричной (эрмитовой) положительно определенной матрицей методом Холецкого и оценка обратного числа обусловленности, или решение системы с симметричной (эрмитовой) положительно определенной матрицей методом Холецкого и с итерационным уточнением решения и оценкой границ ошибок соответственно |
PDPOTRF - PZPOTRF | Треугольное разложение симметричной (эрмитовой) положительно определенной матрицы методом Холецкого |
PDPOTRS - PZPOTRS | Решение системы с симметричной (эрмитовой) положительно определенной матрицей с использованием разложения Холецкого, полученного подпрограммой PDPOTRF(PZPOTRF) Выполнение итерационного уточнения решения системы A X = B, AT X = B или AH X = B, полученного подпрограммой PDGETRS (PZGETRS), и оценка границ ошибок полученного решения |
MINTPOSV - | Построение некоторой "стандартной" матрицы системы и вектора правой части заданного порядка N и распределение их частей(блоков) по параллельным процессам ( в том случае, если не были заданы файлы с исходными матрицей и вектором ) |
Замечания по использованию
1. | Используются подпрограммы BLACS_EXIT, BLACS_GET, BLACS_GRIDEXIT, BLACS_GRIDINFO BLACS_GRIDINIT, BLACS_PINFO, BLACS_SETUP ( из пакета BLACS в составе MKL-библиотеки), DESCINIT, ICEIL, NUMROC, PDLAPRNT ( из пакета ScaLAPACK(TOOLS) в составе MKL-библиотеки), PDLAREAD, PDLAWRITE, MPI_Wtime() | |
2. | Время, затраченное на решение задачи, присваивается переменной time, описанной в общем блоке |
Требуется вычислить время, необходимое для решения системы уравнений с помощью подпрограммы PDPOSV.
Матрица системы - порядка 7000. Для решения задачи предполагается использовать 8 процессоров,
образующих решетку 1 * 8.
Матрица делится на блоки 56 * 56 (т.е. NB = 56 )
При предварительном обращении к подпрограмме PAR_POSV с указанными выше параметрами был вычислен
максимальный размер локальной памяти, необходимой для решения задачи MMIN = 6333237.
Для вычисления используется "стандартная" матрица, построение и распределение которой по процессам
выполняется служебной подпрораммой MINTPOSV.
Фрагмент фортранного текста вызывающей программы
(полный текст теста можно получить в
tcl_posvn.zip)
PROGRAM TCL_POSVN include 'mpif.h' INTEGER CTXT, N, NPROW, NPCOL, NB, NPRT, MEMSIZE PARAMETER ( N=7000, NB=56, MEMSIZE=6333300, NPRT= 1 ) * DOUBLE PRECISION AMEM( MEMSIZE ) CHARACTER*(*) NAME, UPLO CHARACTER INFILEA*(*), INFILEB*(*), OUTFILE*(*), TFILE*(*) PARAMETER ( INFILEA = ' ', INFILEB = ' ', $ OUTFILE = 'BSTPARRES', $ TFILE = 'BSTRES') * PARAMETER ( UPLO = 'U', $ NAME = 'PDPOSV') COMMON time, J EXTERNAL CAL_POSVN, BLACS_GET, BLACS_GRIDINIT, BLACS_GRIDINFO * NPROW = 1 NPCOL = 8 * J = 1 * CALL BLACS_GET( -1, 0, CTXT ) * CALL BLACS_GRIDINIT( CTXT, 'R', NPROW, NPCOL ) CALL BLACS_GRIDINFO( CTXT, NPROW, NPCOL, MYROW, MYCOL ) * CALL CAL_POSVN(NAME, UPLO, N, NPROW, NPCOL, AMEM, MEMSIZE, $ NB, INFILEA, INFILEB, OUTFILE, TFILE, NPRT, CTXT ) * STOP END Результаты: Время решения задачи time = 0.420D+01 Решение системы (в файле OUTFILE) X = ( 1.D0, 2.D0, 3.D0, . . . . . . . . . 6999.D0, 7000.D0 ) Добавим, что минимальное время получено для решетки ( 4, 2 ) и NB = 120 time = 0.258D+01