Организация вызова целевой подпрограммы Комплекса для вычисления собственных значений в обобщенной проблеме собственных значений для симметричных матриц и вычисление времени, затраченного на решение задачи
Эта служебная подпрограмма организует за пользователя правильный вызов
целевых программ вычисления собственных значений в обобщенной проблеме
собственных значений одного из трех видов
(1) Аx = lBx ,
(2) АBx = lx или
(3) BАx = lx
для вещественных симметричных матриц. Кроме того она вычисляет время решения
задачи на заданном числе параллельных процессов (NPROCS) с матрицами заданного
порядка (N) и при заданных параметрах распараллеливания (NPROW, NPCOL, NB ).
Сначала она либо считывает из внешних файлов, заданные пользователем исходные матрицы,
либо строит некие "стандартные" матрицы порядка N; распределяет их части(блоки)
по параллельным процессам в соответствии с используемыми алгоритмами и формирует
правильный список фактических параметров для выбранной пользователем целевой подпрограммы.
После чего осуществляет вызов и счет по этой подпрограмме, вычисляя
при этом время, прошедшее с момента обращения к подпрограмме до момента выхода из неё.
Полученное решение задачи записывается во внешний файл.
Литература:
http://software.intel.com/en-us/articles/intel-math-kernel-library-documentation/
http://www.netlib.org/scalapack/slug/index.html
http://num_anal.srcc.msu.ru/par_prog/
CALL CAL_SYGV1N(IBTYPE, NAME, UPLO, N, NPROW, NPCOL, AMEM, MEMSIZE, NB, VL, VU, IL, IU, ABSTOL, INFILEA, INFILEB, OUTFILE, TFILE, NPRT, CTXT)
Параметры
IBTYPE - |
определяет вид обобщенной проблемы собственных значений: если IBTYPE = 1 - вид (1); если IBTYPE = 2 - вид (2); если IBTYPE = 3 - вид (3); (входной параметр, тип целый); |
NAME - | имя целевой подпрограммы, с помощью которой пользователь собирается решать свою задачу (одно из PDSYGV1, PDSYGV3, PDSYGV5); (входной параметр, тип символьный); |
UPLO - | переменная символьного типа, означающая, используется верхний или нижний треугольник матрицы и принимающая значения 'U' или 'L' соответственно (входной параметр); |
N - | порядок исходной матрицы (входной параметр, тип целый); |
NPROW - | число строк в решетке процессов, которое было выдано пользователю соответствущей подпрограммой вычисления параметров PAR_SYGV1(см.Автоматизация доступа к подпрограммам Комплекса (входной параметр, тип целый); |
NPCOL - | число столбцов в решетке процессов, которое было выдано пользователю соответствущей подпрограммой вычисления параметров PAR_SYGV1(см.Автоматизация доступа к подпрограммам Комплекса (входной параметр, тип целый); |
AMEM - | массив локальной рабочей памяти, в которую распределяется локальная часть исходной матрицы, хранятся элементы рабочих массивов, где формируются локальные части массива собственных значений (входной параметр, тип DOUBLE PRECISION); |
MEMSIZE - | задаваемый размер массива AMEM, который должен быть больше или равен значению параметра MMIN, выданному пользователю соответствующей подпрограммой вычисления параметров PAR_SYGV1 (см.Автоматизация доступа к подпрограммам Комплекса (входной параметр, тип целый); |
NB - | размер блока, матрицы, выданный пользователю соответствующей подпрограммой вычисления параметров PAR_SYGV1 (или фигурировавший в качестве входного значения при вычислении значений других параметров) (см.Автоматизация доступа к подпрограммам Комплекса (входной параметр, тип целый); |
VL - | заданная нижняя граница интервала, в котором ищутся собственные значения при использовании подпрограммы PDSYGV3 (в других случаях положить равной нулю) (входной параметр, тип DOUBLE PRECISION); |
VU - | заданная верхняя граница интервала, в котором ищутся собственные значения при использовании подпрограммы PDSYGV3 (в других случаях положить равной нулю) (входной параметр, тип DOUBLE PRECISION); |
IL - |
заданная нижняя граница интервала индексов, в котором
ищутся собственные значения при использовании подпрограммы PDSYGV5
(в других случаях положить равной нулю); предполагается, что собственные значения располагаются по возрастанию; IL і 1; (входной параметр, тип целый); |
IU - | заданная верхняя граница интервала индексов, в котором ищутся собственные значения при использовании подпрограммы PDSYGV5 (в других случаях положить равной нулю); предполагается, что собственные значения располагаются по возрастанию; min ( IL, N) Ј IU Ј N; (входной параметр, тип целый); |
ABSTOL - |
заданная абсолютная точность, с которой должны быть вычислены
собственные значения (при NAME = 'PDSYGV1' не используется); заданная точность считается достигнутой, если собственное значение лежит в интервале [a, b], ширина которого не превосходит ABSTOL + EPS * MAX ( | a |, | b | ), где EPS - машинная точность; если ABSTOL Ј 0, то ABSTOL полагается равным EPS * norm ( D ), где norm ( D ) - первая норма трехдиагональной матрицы, полученной посредством преобразования матрицы A к трехдиагональной форме; собственные значения будут вычислены с наибольшей точностью, если ABSTOL = 2 * PDLAMCH ('S'), где PDLAMCH ('S') = sfmin - минимальное вещественное число, при котором 1 / sfmin не вызывает переполнения; (входной параметр, тип DOUBLE PRECISION); |
INFILEA - | имя файла, содержащего исходную матрицу (A) либо " "(пробел) (входной параметр, тип символьный); |
INFILEB - | имя файла, содержащего исходную матрицу (B) либо " "(пробел) (входной параметр, тип символьный); |
OUTFILE - | имя файла, в который в результате работы подпрограммы будет записан результирующий массив собственных значений (входной параметр, тип символьный). |
TFILE - |
имя файла, в который записывается время, затраченное на решение
задачи при заданном наборе параметров распараллеливания; при обращении к подпрограмме CAL_SYGV1N в цикле с разными наборами параметров распараллеливания в данный файл будут записаны все результаты таймирования, полученные при всех вычислительных экспериментах, выполненных в данном запуске подпрограммы BSTPAR9, инициирующей групповой запуск нескольких вычислительных экспериментов (т.е. нескольких вызовов подпрограммы CAL_SYGV1N с разными наборами параметров) (входной параметр, тип символьный); |
NPRT - |
режим выдачи результатов вычислительного эксперимента: = 0 - на печать не выдается ничего, кроме минимального времени счета полученного в данном эксперименте и значений параметров распараллеливания, при которых получено это минимальное время; = 1 - на печать выдаются все результаты таймирования ( при всех испытанных в данном групповом запуске наборах параметров распараллеливания ); = 2 - на печать выдается все то же самое, что и при NPRT = 1, а также результаты решения самой задачи целевой программой Комплекса для заданной матрицы; = 3 - на печать выдается все то же самое, что и при NPRT = 2, а также все входные параметры и матрицы (входной параметр, тип целый); |
CTXT - | значение параметра контекста, соответствующего выбранной решетке процессов (входной параметр, тип целый) |
Вызываемые подпрограммы
Здесь указаны только целевые (1 - ого уровня) и базовые подпрограммы (2 - ого уровня), которые вызываются из целевых подпрограмм.
PDSYGV1 -
PDSYGV3 PDSYGV5 |
вычисление всех собственных значений в обобщенной проблеме
собственных значений для вещественных симметричных матриц
двойной точности; вычисление собственных значений в обобщенной проблеме собственных значений (для вещественных симметричных матриц двойной точности), принадлежащих заданному интервалу; вычисление собственных значений в обобщенной проблеме собственных значений (для вещественных симметричных матриц двойной точности), принадлежащих заданному интервалу индексов соответственно |
PDSYEV1 -
PDSYEV3 PDSYEV5 |
вычисление всех собственных значений симметричной матрицы
для вещественных данных двойной точности; вычисление собственных значений симметричной матрицы, принадлежащих заданному интервалу, для вещественных данных двойной точности; вычисление собственных значений симметричной матрицы, принадлежащих заданному интервалу индексов, для вещественных данных двойной точности, соответственно |
PDPOTRF - PZPOTRF | Треугольное разложение симметричной (эрмитовой) положительно определенной матрицы методом Холецкого |
PDSYTRD - | приведение симметричной матрицы к трехдиагональной форме методом отражений |
DSTEQR2 - | вычисление всех собственных значений и, возможно, собственных векторов симметричной трехдиагональной матрицы |
PDSYNTRD - | приведение симметричной матрицы к трехдиагональной форме методом отражений |
PDSYNGST - | приведение обобщенной проблемы собственных значений к стандартному виду |
PDSTEBZ - | вычисление собственных значений симметричной трехдиагональной матрицы |
MINTSYGV1 - | Построение некоторых "стандартных" матриц заданного порядка N и распределение их частей(блоков) по параллельным процессам ( в том случае, если не были заданы файлы с исходными матрицами ) |
Замечания по использованию
1. | Используются подпрограммы BLACS_EXIT, BLACS_GET, BLACS_GRIDEXIT, BLACS_GRIDINFO BLACS_GRIDINIT, BLACS_PINFO, BLACS_SETUP ( из пакета BLACS в составе MKL-библиотеки), DESCINIT, ICEIL, NUMROC, PDLAPRNT ( из пакета ScaLAPACK(TOOLS) в составе MKL-библиотеки), PDLAREAD, PDLAWRITE, MPI_Wtime() | |
2. | Время, затраченное на решение задачи, присваивается переменной time, описанной в общем блоке |
Требуется вычислить время, необходимое для вычисления собственных значений с помощью подпрограммы PDSYGV1.
Матрица системы - порядка 7000. Для решения задачи предполагается использовать 8 процессоров,
образующих решетку 2 * 4.
Матрица делится на блоки 18 * 18 (т.е. NB = 18 )
При предварительном обращении к подпрограмме PAR_SYGV1 с указанными выше параметрами был вычислен
размер локальной памяти, необходимой для решения задачи MMIN = 25119769.
Для вычисления используется "стандартная" матрица, построение и распределение которой по процессам
выполняется служебной подпрораммой MINTSYGV1.
Фрагмент фортранного текста вызывающей программы
(полный текст теста можно получить в
tcl_sygv1n.zip)
PROGRAM TCL_SYGV1N * include 'mpif.h' * INTEGER CTXT, N, NPROW, NPCOL, NB, NPRT, MEMSIZE, $ NOUT1, NOUT, NPR, IL, IU, IBTYPE PARAMETER ( N=7000, NB=18, MEMSIZE= 25200000, NPRT= 1 ) * DOUBLE PRECISION AMEM( MEMSIZE ), VL, VU, ABSTOL CHARACTER*(*) NAME, UPLO CHARACTER INFILEA*(*),INFILEB*(*), OUTFILE*(*),TFILE*(*) PARAMETER ( NOUT1 = 12, NOUT =13, NPR = 6 ) PARAMETER ( INFILEA = ' ', INFILEB = ' ', $ OUTFILE = 'cal_sygv1n.res', $ TFILE = 'cal_sygv1n.tres') * PARAMETER ( UPLO = 'U', NAME = 'PDSYGV1') DOUBLE PRECISION time COMMON time, J EXTERNAL CAL_SYGV1N, BLACS_GET, BLACS_GRIDINIT, $ BLACS_GRIDINFO * NPROW = 2 NPCOL = 4 * VL = 0.D0 VU = 0.D0 IL = 0 IU = 0 ABSTOL = 0.D0 IBTYPE = 1 * J = 1 * CALL BLACS_GET( -1, 0, CTXT ) * CALL BLACS_GRIDINIT( CTXT, 'R', NPROW, NPCOL ) CALL BLACS_GRIDINFO( CTXT, NPROW, NPCOL, MYROW, MYCOL ) * IF( MYROW.EQ.0 .AND. MYCOL.EQ.0 ) THEN * * Открытие файла пользователя для записи результатов таймирования * OPEN( NOUT1, FILE = TFILE, STATUS = 'UNKNOWN' ) * Запись в файл имени используемой подпрограммы, * порядка матрицы, числа процессоров и размера блока * WRITE( NOUT1, FMT = 27 ) NAME, N, NPROW*NPCOL, NB * END IF * IBTYPE = 1 * CALL CAL_SYGV1N(IBTYPE, NAME, UPLO, N, NPROW, NPCOL, AMEM, $ MEMSIZE, NB, VL, VU, IL, IU, ABSTOL, $ INFILEA, INFILEB, OUTFILE, TFILE, NPRT, CTXT) * * Выдача на печать и запись в файл времени счета задачи * и параметров, при котором оно достигнуто * IF( MYROW.EQ.0 .AND. MYCOL.EQ.0 ) THEN WRITE( NPR, FMT = 21 ) NPROW, NPCOL, NB, time * WRITE( NOUT1, FMT = 21 ) NPROW, NPCOL, NB, time * END IF * CLOSE( NOUT1 ) * CALL BLACS_GRIDEXIT( CTXT ) CALL BLACS_EXIT( 0 ) * 27 FORMAT( /A8,' N = ',I5,' NPROCS = ',I3,' NB = ',I3/) 21 FORMAT( 'время получено для решетки (',I3,','I3, $ ' ) и NB = ', I3, D14.3/ ) * STOP END * SUBROUTINE MINTSYGV1( N, A, DESCA, B, DESCB, INFO ) * * MINTSYGV1 генерирует и распределяет матрицы A и B порядка N * по решетке процессов (NPROW, NPCOL) для контекста, * содержащегося в дескрипторах матриц A и B. * Матрицы A и B симметричные трехдиагональные. * * Параметры INTEGER DESCA( * ), DESCB( * ), N, INFO DOUBLE PRECISION A( * ), B( * ) * INTEGER I, J * EXTERNAL PDELSET * DO 2 J = 1, N DO 1 I = 1, N CALL PDELSET( A, I, J, DESCA, 0.0D0 ) CALL PDELSET( B, I, J, DESCB, 0.0D0 ) 1 CONTINUE 2 CONTINUE DO 4 J = 1, N DO 3 I = 1, N IF( I.EQ.J ) THEN CALL PDELSET( A, I, J, DESCA, 2.0D0 ) CALL PDELSET( B, I, J, DESCB, 5.0D0 ) END IF 3 CONTINUE 4 CONTINUE * DO 5 I = 1, N-1 J = I + 1 CALL PDELSET( A, I, J, DESCA, 1.0D0 ) CALL PDELSET( B, I, J, DESCB, 1.0D0 ) 5 CONTINUE * DO 7 J = 1, N-1 I = J + 1 CALL PDELSET( A, I, J, DESCA, 1.0D0 ) CALL PDELSET( B, I, J, DESCB, 1.0D0 ) 7 CONTINUE * RETURN END Результаты: Время решения задачи time = 0.996D+02 Собственные значения матрицы (в файле OUTFILE) W = ( 6.71209816 -008 , 2.68483859 -007 , . . . , 0.571428522 , 0.5714285591 ) Добавим, что минимальное время получено для решетки ( 2, 4 ) и NB = 30 time = 0.903D+02